Il faut savoir que j’ai horriblement peur des requins. On peut être biologiste et irrationnel. Donc normalement, je m’attends à regarder un truc ultra-flippant qui va me forcer à dormir pour ne pas continuer à regarder. Comprenne qui pourra. Mais au bout d’un quart d’heure de film, je n’avais -presque- plus peur. Par contre, j’étais en train de relever toutes les aberrations. Le naturel revient en crawl (ben oui, on est dans la flotte).

Un requin tigre un peu nul même pas transgénique. Crédit: Albert kok

Récapitulatif du scénario d’une complexité qui va vous laisser pantois (es). Une équipe de “scientifiques” (oui, je ne peux pas m’en empêcher), travaille sur une plate forme, originalement nommée Aquatica, plus ou moins sous-marine (la topographie des lieux n’est jamais très claire, même s’ils passent leur temps à dire “allez, on va prendre le couloir B14 pour remonter vers le 3ème niveau où il y un sous-marin pour repasser à la surface”. Gné? D’ailleurs autant vous prévenir tout de suite: le sous-marin ne passe pas les 30 premières minutes). Ils bossent sur une protéine présente dans le cerveau desdits requins, qu’ils n’ont pas modifiés génétiquement parce que c’est interdit. Sauf qu’en fait, si, tatatsin. Et là, paf, les requins se mettent à attaquer tout le monde. Ils crèvent tous un par un. Quand j’ai éteint la télé, de façon toujours aussi unilatérale parce que bon, je travaille le lundi quand même, il n’en restait que trois. Mais pour un d’entre eux, ça sentait méchamment le sapin (ou l’algue, plutôt).

On n’a pas aimé:

-la nana qui hurle “oh mon dieu il fait une hémorragie” alors que ca fait 10 minutes qu’elle examine un type qui pisse le sang parce qu’un requin lui a arraché le bras. Enfin bon, pas besoin d’être une brillante scientifique pour savoir que quand on perd son sang, par définition, c’est une hémorragie.

- le moment où ils regardent des neurones au microscope. Je sais qu’il y a des spécialistes du neurone dans la salle, ils me contrediront si j’ai tort mais: on ne cultive pas des neurones à même la table, à l’air libre. On ne peut pas voir que “les membranes se renforcent” (d’ailleurs, comment ca les membranes se renforcent?) parce qu’on leur a balancé un produit dessus. Et les neurones ne font pas des “arcs électriques” visibles à l’œil nu.

- l’explication de la modification génétique sur le requin. Déjà, je ne suis pas sûre que d’un point de vue pratique, on soit capable de le faire (quelqu’un est au taquet sur la Fécondation In Vitro chez le requin tigre?). Et ça m’étonnerait beaucoup qu’on soit capable d’augmenter la taille du cerveau de requin par génie génétique. Et quand bien même, ça n’augmenterait pas proportionnellement leur intelligence, comme miss scientifique le rappelle toutes les 5 secondes.

-d’ailleurs, on n’aime pas beaucoup le personnage de miss scientifique. Ne me demandez pas son nom, j’ai déjà oublié. Évidemment, elle est froide, désagréable, manipulatrice, et se moque de la mort de tout le monde tant que la science avance. Je vous rassure, à la fin du film, elle doit probablement tomber dans les bras du beau repris de justice musclé, blond et con. Comme quoi, même la froide scientifique fond devant la mâle virilité.

-le moment où le cuisinier s’enferme dans son four pour échapper à un vilain squale. Ledit squale allume le four (si, si). Mais là le type avait une hache, oui, avant de s’enfermer dans le four il s’était muni d’une hache. Prévoyant, le mec. Après il défonce le toit du four, ce qui paraît hautement improbable. Et, au lieu de lui balancer un grand coup de hache dans sa face comme n’importe qui, il plonge par dessus le requin au risque de se faire choper en plein vol, il arrive à la porte, et comme y a du gaz partout, il n’a plus qu’à s’allumer une clope en sortant de la pièce, sans une égratignure. Sous la pression, il a quand même pas mal de ressource. Et en plus, on l’a déjà vu dans les dents de la mer, ça.

On a aimé: – le moment où elle électrocute un requin. Miss scientifique se fout à poil (ce qui m’a amené à dire, car je suis très mauvaise langue: “ça manquait quand même un peu de fille en bikini”). Et se met debout sur sa combinaison d’homme grenouille avant d’arracher un câble monumental et de le balancer dans la flotte. Pas mal, car elle électrocute le gros requin pas sympa, mais le plastique fait isolant et elle s’en sort! Tadam! (j’ai quand même des doutes).

-le moment où le grand noir à lunettes fait un speech gnangnan sur le thème “on s’aime, il faut tous rester ensemble et s’entraider car l’entraide et l’amour…” et là paf y a un requin qui jaillit du bassin et le bouffe en live. Ça c’est pas scientifique, mais ça nous évite un moment pénible.

Erratum: je viens d’apprendre qu’en fait, miss scientifique y passe, ce qui permet d’établir une bonne morale bien pensante, sur le thème de la punition (car c’est elle qui a modifié génétiquement les requins, en secret! La garce).

]]> http://blog.pressebook.fr/agchaigne/2010/05/03/les-dents-de-la-mer-2-le-retour-de-la-vengeance-du-requin-mechant-et-transgenique/feed/ 4 http://blog.pressebook.fr/agchaigne/2010/04/17/la-fun-specie-du-week-end-wolbachia-le-parasite-de-linsecte-transexuel/ http://blog.pressebook.fr/agchaigne/2010/04/17/la-fun-specie-du-week-end-wolbachia-le-parasite-de-linsecte-transexuel/#comments Sat, 17 Apr 2010 15:33:19 +0000 Agathe Chaigne http://blog.pressebook.fr/agchaigne/?p=424

Après de longues semaines de silence, THE blog is back avec toujours plus de délire biologique.

Cette nouvelle fun specie sera forcément moins funky que la précédente. Mais il faut bien reconnaître que le Gibbon est difficile à surpasser. Pour essayer de rester à la hauteur, je vais donc parler de sexe, et plus précisément de transexualité. Et même, de transexualité d’insectes.

Wolbachia est une bactérie qui parasite certains arthropodes, et notamment beaucoup d’insectes, mais aussi des vers et des araignées. Cette bactérie s’installe dans les cellules germinales ce qui lui permet d’être transmise. Mais attention: elle se transmet seulement de mère en fille. Du coup, elle a un certain nombre de stratégies qui lui permettent d’optimiser le nombre de femelles.

Elle peut par exemple tuer les mâles qu’elle infecte. Elle peut aussi induire la parthénogénèse, c’est-à-dire la formation d’un individu femelle à partir d’un individu femelle, sans intervention de spermatozoïde.  Elle peut également féminiser les individus mâles qu’elle infecte. Elle peut enfin empêcher les mâles qu’elle infecte de se reproduire avec des femelles qu’elle n’infecte pas. Finalement l’intérêt reste d’être le plus possible présent dans l’espèce considérée.

Wolbachia dans des cellules d'insectes (Crédit photo: Scott O'Neill)

Certaines espèces qui sont infectées par une souche de Wolbachia deviennent dépendant de celle-ci pour leur reproduction ou leur survie. Des recherches sont en cours, dans le cadre de l’élimination de maladies comme l’éléphantiasis, pour éliminer Wolbachia du parasite qui cause la maladie, afin de rendre le parasite moins virulent ou même de le tuer.

Un petit exemple: un article publié dans Proceedings of the Roay Societyof Biological Science. Non, ne fuyez pas, c’est super simple! Une petit chenille, celle du papillon Phyllonorycter blancardella avait besoin de manger pendant l’hiver. Mais à cette époque, les feuilles ne font pas de photosynthèse, il n’y a pas de nutriments et en plus elles tombent. Y a rien de tel qu’un bon Pinophyte, qui garde ses épines en hiver, mais bon, le chenille veut se taper du pommier. Alors, grâce au métabolisme de Wolbachia qui la parasite, elle se débrouille pour que la feuille reste chlorophyllienne, du coup elle peut manger. Et au printemps, se transformer en beau papillon, et me permettre de finir ce post sur une note un peu lyrique, parce que la biologie, c’est quand même super.

La présence de la chenille (et de son parasite Wolbachia) empêche la mort de la feuille

A cette occasion, sur France Inter, un invité répondait aux questions du journaliste (et aussi des auditeurs, mais là j’avais éteint ma radio d’énervement à coups de latte): Jean-François Delfraissy, président de l¿Agence Nationale de Recherche sur le Sida. Mais auparavant, une journaliste (dont j’ai oublié le nom) a fait pour l’auditeur inculte un petit briefing sur le Sida, et sur sa prévention. J’ai cru que je dormais encore. Car elle a dit (ce ne sont pas les mots exactes, mais l’idée est là): “il faut faire de la prévention dans les communautés homosexuelles, toxicomanes et dans les populations de migrants“.

Et là mesdames et messieurs, certains d’entre vous sont soulagés: vous êtes français depuis 78 générations, peut-être même vendéen, vous fumez un occasionnel joint mais à part ça le truc le plus chaud que vous ayez fait est sniffer votre bâton de colle Uhu à l’école primaire, et vous êtes hétéro. Vous êtes tranquille! Le Sida ce n’est pas pour vous. Vous allez dire que je suis mauvaise, qu’elle voulait probablement dire “surtout dans les communautés blabla“. Mais elle n’a pas dit dit, et la banalisation, c’est la pire chose qui puisse arriver. Car si on commence à croire que dans notre communauté de blancs hétérosexuels du 5e arrondissement on est tranquille, on ne fait plus attention. Et le Sida, ça s’attrape comme ça.

Petit rajout: à un autre moment entre 8h et 8h30, le monsieur qui répondait aux questions a dit que maintenant, avec le traitement, il n’y avait plus de risque de contaminer le partenaire. Ah bon? La trithérapie protège mieux que la capote? J’attends les explications de quelqu’un qui s’y connaît en virologie, mais cela me semble terriblement inexact et dangereux, comme remarque.

Gibbons à main blanche

Le Gibbon est un animal absolument charmant. C’est bien sûr un primate, de la famille des Hylobatidés. Il en existe 15 espèces, par exemple le Gibbon à mains blanches, le Gibbon argenté et le siamang. Mais ils sont tous très beaux, dans leur genre. Comme tous les grands singes, ils n’ont pas de queue.

Un arbre phylogénétique des Primates (D. Goldman, P. R. Giri and S. J. O'Brien in Proc Natl Acad Sci U S A (1987) )

Comme vous pouvez le voir, le Gibbon a de très grands bras. Il se déplace assez peu sur ses pattes, mais il se déplace de branches en branches avec ses bras: c’est la brachiation. D’ailleurs si vous faites attention, ils ont des bras super musclés, par rapport à la taille de leur corps. Ils ont un sens de l’équilibre tout à fait remarquable, que vous pourrez apprécier dans la vidéo. Ils dorment dans des arbres mais ne font pas de nid.

Gibbon en pleine brachiation. Crédit: Ltshears

Les Gibbons sont monogames. Ca n’a l’air de rien comme ça, mais finalement y en a pas tant que ça, des espèces monogames. Ils se nettoient les uns les autres. Les femelles n’ont qu’un bébé à la fois (rarement deux) et s’en occupent jusqu’à sa maturité. Quand il commence à réclamer un scooter et à rentrer tard en sentant le tabac, ils le mettent dehors et il doit intégrer un nouveau groupe pour se reproduire. C’est souvent le cas dans les groupes sociaux, et cette particularité permet d’éviter la consanguinité.

Les gibbons sont omnivores et mangent des feuilles, des œufs, des insectes…Ils habitent en Asie du Sud Est, il n’y en a pas en France malheureusement. Sauf un, qui vit chez moi. Il écrit un roman. Lui, il mange surtout du saumon fumé, mais il faut reconnaître qu’il est un peu snob.

Les Gibbons vivent une quarantaine d’années. Ce sont des animaux qui communiquent en criant; chez certaines espèces il y a même présence de sacs vocaux (un peu comme chez le crapaud).  C’est une manière de manifester leur présence sur leur territoire.

envoyé par zoo_palmyre.

Certaines espèces, comme le Gibbon à mains blanches, sont aujourd’hui menacées, notamment par la déforestation, et aussi par le braconnage. D’ailleurs en début d’année, un bébé Gibbon a été volé dans un zoo. Comme c’est une espèce menacée, des gens sont prêts à payer très cher pour en avoir un.

Mais il y a des centres de protection des Gibbons: le Gibbon conservation center par exemple, et un centre de recherche sur le Gibbon, à Zurich. Sur ce site, vous pourrez trouver des photos, des sons de Gibbons, des publications sur le Gibbon. Comme quoi, ce n’est pas juste moi: le Gibbon, c’est tout simplement fantastique.

1) dimanche soir, pour les élections régionales, j’ai entendu de façon répétée des gens comparer des pourcentages. Je ne me souviens plus des chiffres exactes, mais cela donnait quelque chose comme “enfin voyons monsieur X, 21% c’est plus que 14%!”. Ben non, ça dépend 14% de quoi, et 21% de quoi. Et comme en l’occurrence pour les élections on parle en pourcentage de suffrages exprimés, si le nombre de votants est différent, on peut très bien avoir 14% des votants à l’élection A > 21% des votants à l’élection B. D’ailleurs, j’aimerai bien comprendre pourquoi on ne parle pas en pourcentage des suffrages exprimables (c’est à dire le nombre de gens inscrits sur les listes électorales). Ça aurait tout autant un sens, on pourrait comparer les élections entre elles, et cela montrerait par la même occasion la représentativité des élus.

2) Un débat avec Claude Allègre, à la télé la semaine dernière. Tout d’abord, il a dit qu’il ne voyait pas comment le climat se réchauffait puisque l’hiver avait été froid. Pour quelqu’un qui se prétend climatologue, confondre météo et climat, ça craint.Et puis,  il a prononcé cette phrase magnifique, venant de quelqu’un qui se prétend scientifique : “Je ne me suis jamais trompé“. Et ça, pour un scientifique, c’est juste bluffant.

L'axolotl et ses branchies externes (Crédit: Henry Mühlpfordt)

Pour commencer en beauté ce week-end end, je vous propose de découvrir l’Axolotl. Notons tout d’abord qu’il a un nom sympathique. D’après wikipédia, son nom viendrait du nahuatl pour “chien d’eau”. Les Aztèques ne devaient pas avoir les yeux en face des trous parce que ca ne ressemble que moyennement à un chien. Pas un chien que j’aurai envie d’avoir dans ma cuisine en tout cas. Il vit en Californie et au Mexique.

La principale caractéristique de cette bestiole, qui fait partie du groupe des Lissamphibiens (grenouilles et autres salamandres), c’est de ne pas faire de métamorphose et de conserver toute sa vie un état larvaire. En fait, il ressemble à une larve de salamandre qui n’aurait pas fait de métamorphose. Sous l’action des hormones thyroïdiennes (synthétisées par la glande thyroïdienne), la salamandre subitbune métamorphose qui la fait passer d’un état larvaire, aquatique, à un état adulte. Chez la grenouille (amphibien aussi, mais anoure et non pas urodèle: c’est à dire “sans queue”), c’est la transition entre un têtard herbivore, microphage, aquatique à respiration branchiale et un adulte terrestre, carnivore, à respiration bucco-pulmonaire, mature sexuellement.

Sauf que ce petit Axolotl a un déficit en hormones thyroïdiennes. Du coup, il conserve toute sa vie des caractères larvaires, comme les branchies externes: c’est ce qu’on appelle la néoténie. Si on lui injecte des hormones, il devient une salamandre (Ambystoma)!

Une autre caractéristique des axolotl est sa capacité de régénération, comme chez la salamandre.  On peut lui enlever parfois des organes presque entiers et il peut les régénérer. Il supporte très bien les greffes.

Et surtout, il a des branchies externes. Et ça, c’est une qualité en soi.

Pour information, le texte Axolotl de Julio Cortazar, qui raconte l’histoire d’un type qui devient un axolotl. Je ne sais pas quoi en penser. Et vous?

Un tardigrade adulte (photo: Goldstein lab)

Le tardigrade est un animal fantastique, pour tout un tas de raisons:

1) Il est super mignon. Il ressemble à un petit ourson, avec plein de bras. D’ailleurs on l’appelle parfois ourson d’eau. Par contre, il est tout petit, un millimètre. Actuellement, on le place dans la classification proche des Arthropodes (le groupe qui contient les araignées, les crustacés et les insectes), mais sa position n’est toujours pas certaine.

2) Il est excessivement résistant. On le trouve dans tous les milieux, dans les montagnes, dans l’eau. Ils peuvent survivre dans l’espace, ils résistent au vide et aux rayons ultraviolets. Ils peuvent survivre à des températures très hautes, et très basses. Ils peuvent survivre à une déshydratation de 99%, ce qui leur permet de rentrer dans une vie ralentie (la cryptobiose) dans laquelle ils peuvent passer quelques années, avant de repartir comme avant.

3) Les scientifiques les adorent tellement qu’un d’entre eux en a fait un clip. Avec un solo de guitare électrique. Si, si.

Music by Ekoostik Hookah , video by Steven J Myers

Solanum tuberosum, la pomme de terre (Solanacées)

Tiens c’est vrai ça. Tout le monde s’énerve sur la patate transgénique, pour dire qu’elle est démoniaque, ou au contraire qu’elle va régler tous nos problèmes, mais qu’est ce qu’il a de modifié, ce brave tubercule? Je suis donc allée voir dans les journaux.

Regardons les premiers articles des quotidiens nationaux sur Amflora, la pomme de terre transgénique qui sera peut-être bientôt commercialisée: l’article du Figaro ne fait pas du tout mention de la modification génétique. L’article de 20 Minutes non plus. Pas plus que l’article du Point.

Dans l’article du Monde il y a l’information: la pomme de terre a été “génétiquement modifiée afin d’augmenter son contenu en un composant chimique de l’amidon, l’amylopectine, dans le but de satisfaire des usages dans l’industrie du papier”. L’information est aussi présente dans l’article de Libération. Mais quel est ce gène précisément, quelle enzyme code-t-il? On ne saura pas.

C’est quand même curieux qu’on parle assez peu de ce qui a été effectivement modifié dans la pomme de terre OGM. Finalement, c’est quand même ça qui devrait nous intéresser. Sur le blog Pris(m)e de tête, un article m’avait marqué, qui présentait le concept de “deficit model“: pour faire simple, si les gens refusent, c’est qu’ils ne comprennent pas. Le concept est un peu simple, mais il contient sûrement une part de vérité. Peu de gens comprennent effectivement quelque chose à l’ingénierie génétique; et personne n’explique vraiment ce qui se passe. Ce qui donne lieu a beaucoup de confusion. Le même billet cite un sondage: 35% des européens sont d’accord avec la proposition “les tomates génétiquement modifiées contiennent des gènes, et les autres non”. Waou.

Alors forcément, si on nous rebat les oreilles de patates OGM sans jamais nous expliquer ce qu’elles ont de génétiquement modifié, ça ne va pas aider grand-monde, ni à accepter cet OGM, ni à le refuser, d’ailleurs. On parle beaucoup d’un gène de résistance à l’antibiotique, qui poserait des problèmes. Pourquoi ce gène est-il là? Mystère.

Ayant déjà fait de la modification génétique, je suppose que c’est un gène de sélection: lorsqu’on insère la séquence génétique contenant le gène d’intérêt, en l’occurrence le gène qui augmente le taux d’amylopectine, on ne peut pas être sûr que le gène a bien été introduit dans la cellule. Pour vérifier, on introduit conjointement un gène de résistance à un antibiotique, puis on met les cellules dans un milieu contenant l’antibiotique. Les cellules ayant intégré la séquence auront le gène de résistance, les autres mourront, et on pourra ainsi récupérer les cellules modifiées.

Mais ce n’est qu’une supposition. Et c’est dommage de ne pas avoir plus d’informations à disposition.

Note tardive: Il suffit que je dise ça, pour que Le Figaro fasse un article sur le sujet… Il semble que la pomme de terre inhibe la synthèse d’amylose, produisant ainsi seulement de l’amylopectine.

Et pour commencer, voici: le Blob-fish. Le blob-fish a plusieurs avantages:

1) Il a un nom super marrant; répétez le vite plusieurs fois: blob fish blob fish blob fish. Avouez que c’est une qualité en soi. C’est beaucoup plus classe que “lieu” ou “sole”. (en fait son vrai nom c’est Psychrolutes phrictus, mais je préfère blob fish)

2) Il a une tête vraiment sympa.

Le blob fish

3) Il est totalement gélatineux.  Cela lui permet de résister à des pressions très élevées (les structures gélifiées résistent bien à la pression, essayez d’écraser une méduse par exemple), et on le trouve d’ailleurs à des très grandes profondeurs, dans les abysses.

Pour voir une joli photo de ce poisson menacé par la pêche, c’est ici, sur le site de Maxisciences.

Le 1 Mars, l’article avait déjà plus de 200 commentaires en ligne. C’est assez rare pour être mentionné. lemonde.fr est un site finalement assez peu visité, ou plutôt relativement peu commenté, par rapport à d’autres sites de journaux en ligne. Mais le sujet fâche. Car voilà encore un article qui réveille la polémique réchauffistes/sceptiques. On va me dire que je parle tout le temps de ça. Mais justement cet article est intéressant, car il souligne le profond débat qui divise encore en ce moment l’opinion.

La science et l'art, batailles et changement de paradigme

Dans cet article, le journaliste analyse des erreurs présentes dans le dernier livre de Claude Allègre,L’imposture climatique. Cet ouvrage est évidemment une nouvelle attaque contre le GIEC et les rapports sur le réchauffement climatique, qualifié de “mythe” . Mais son livre est entaché de diverses erreurs factuelles, qui sont recensées dans l’article: utilisation d’articles inexistants, citations d’auteurs fictifs, erreurs d’interprétations ect.

Mais ce qui est intéressant, ce sont les commentaires des internautes. L’article se penche, comme on l’a vu, sur les fautes de forme dans le live d’Allègre, et sur quelques fautes de fond. Il dé-crédibilise son propos dans cet ouvrage. Mais si l’on regarde les commentaires, on se retrouve face à la sempiternelle bataille entre pro et anti réchauffement climatique. Les climatosceptiques s’en prennent au journaliste qui serait du côté du Complot-Mondial-Pour-Faire-Croire-à-Un-Réchauffement-Climatique-Fictif (ou CMPFCURCF). Les climato-convaincus accusent les autres d’être des Sales-Egoïstes-Qui-s’En-Foutent-De-Voir-Le-Monde-Crever-Et-Eventuellement-A-La-Solde-Des-Compagnies-Pétrolières (SEQ… bref vous m’avez comprise).

Finalement, dire que BHL s’est rendu ridicule en citant un philosophe qui n’existe pas, c’est amusant. Par contre, dire qu’Allègre se discrédite en citant Mme Georgia Tech (alors que c’est le nom d’une université où travaille un des chercheurs qu’il cite) c’est nécessairement prendre position dans un débat sur le réchauffement climatique.

Pourquoi ce débat est-il aussi violent? Pour moi, c’est parce que ce n’est pas qu’un débat scientifique, mais un débat avec des conséquences, notamment sur notre vie. Du coup, chacun se croit légitime pour donner son avis. Même en étant très mal informé. Et vous, qu’en pensez-vous?